Tipicamente, as listas de bloqueio em clientes de torrent estão lá para bloquear qualquer cliente que mostre comportamento "anormal" em relação ao seu cliente - como muitas conexões por segundo, conexões inválidas entre muitas outras.
Embora eu não saiba sobre a Transmissão, alguns clientes de torrent têm recursos de PeerGuardian que bloqueiam os IPs conhecidos que pertencem à lei agências e empresas que são empregadas para atacar, sanguessuga, infiltrar ou processar usuários de redes P2P.
Pode diminuir a velocidade? Sim, provavelmente, você pode não estar recebendo conexões de clientes capazes de enviar dados - no entanto, um dos itens que bloqueia são pessoas enviando dados corrompidos ou inválidos repetidamente, portanto, isso não é necessariamente uma coisa ruim.