No Windows, isso é armazenado no arquivo:
%USERPROFILE%\Local Settings\Application Data\Google\Chrome\User Data\Default\Bookmarks
No Mac OS X, isso é armazenado em:
~/Library/Application Support/Google/Chrome/Default/Bookmarks
Estes são arquivos de texto em formato JSON.
Se você estiver tentando importar / exportar favoritos, provavelmente será melhor exportá-los da interface do usuário. No menu Chave inglesa, vá para Gerenciador de marcadores, clique em Organizar e depois em "Importar favoritos" ou "Exportar favoritos". Isso permite importar / exportar seus favoritos usando um arquivo HTML padrão que outros navegadores também podem importar / exportar.