Os diretórios esqueletos do macOS estão em /System/Library/User Template/
e só podem ser visualizados pelo usuário root.
No entanto, (por padrão) as novas contas de usuário do macOS não têm nenhum arquivo de ponto (você pode testar isso criando uma nova conta de usuário):
Aoide:~ admin$ sudo ls -la /Users/testaccount/
total 8
drwxr-xr-x+ 11 testaccount staff 374 Apr 21 13:13 .
drwxr-xr-x 8 root admin 272 Apr 21 13:12 ..
-r-------- 1 testaccount staff 7 Apr 21 13:12 .CFUserTextEncoding
drwx------+ 3 testaccount staff 102 Apr 21 13:12 Desktop
drwx------+ 3 testaccount staff 102 Apr 21 13:12 Documents
drwx------+ 3 testaccount staff 102 Apr 21 13:12 Downloads
drwx------@ 46 testaccount staff 1564 Apr 21 13:13 Library
drwx------+ 3 testaccount staff 102 Apr 21 13:12 Movies
drwx------+ 3 testaccount staff 102 Apr 21 13:12 Music
drwx------+ 3 testaccount staff 102 Apr 21 13:12 Pictures
drwxr-xr-x+ 5 testaccount staff 170 Apr 21 13:12 Public
Como l0b0 diz, você deve usar uma das muitas opções disponíveis para a versão ou fazer backup de seus próprios arquivos de ponto. Se você tiver problemas, basta excluí-los para restaurar o comportamento padrão.