Você definitivamente precisa de um drive SCSI. Os Macs usavam unidades SCSI exclusivamente até o final dos anos 90. Seu SE não possui um controlador IDE.
Observe também que a última versão do Mac OS que suportava o SE era 7.5.5, que foi logo antes do HFS + ser lançado. Portanto, você estará limitado ao HFS regular, que usou um contador UInt16 para blocos de alocação por volume, o que significa um máximo de 2 ^ 16 ou 65536 blocos. Portanto, se você tivesse uma unidade de 80GiB, um arquivo de 1 byte ocuparia algo como 1,2 MiB. Com um drive de 512 MiB, um arquivo de 1 byte levaria 8K, o que parece mais razoável.