Você não pode acessar nenhum dos buffers de corte do vim de Putty.
O Putty pode cortar o texto marcado do buffer de tela rolável, mas não faz o que você quer quando você precisa selecionar mais linhas do que pode ser visto na janela do Putty porque o vim não preenche o buffer de rolagem do Putty porque Ele usa curses códigos de escape para redesenhar páginas.
O Putty vem com um cliente SCP pscp
que você pode usar para transferir o arquivo de registro para um PC