Eu tive o mesmo problema no passado com o Windows 2003 Server - e ouso dizer que o Vista poderia ser o mesmo - onde dispositivos como suas unidades eSATA simplesmente não são possíveis de serem utilizados.
Foi-me dito que é uma limitação com o próprio sistema operacional 1. não ser capaz de reconhecer certos dispositivos sendo conectados e 2. não conseguir lidar com a remoção desses dispositivos por causa das referências mantidas pelo kernel.
Acabei usando um utilitário de software chamado HotSwap! para desconectar a unidade eSATA. Outro é USB Safely Remove se você quiser outra opção. Para conectar a unidade, pareço lembrar algo do assistente Adicionar novo hardware. No final, eu escrevi um script para adicionar a unidade depois que ela foi conectada usando um utilitário do Windows Resource Kit, da memória.
Btw, DataPort foi o fornecedor que eu usei para gabinetes de unidade e eles forneceram excelente suporte pós-venda. No final, foi muito difícil.