Você precisará executar um detector de borda .
A sintaxe básica é
ffmpeg -i in.mp4 -vf "edgedetect=enable='gt(mod(t,60),57)',negate" -c:a copy out.mp4
O filtro negado é adicionado, pois a saída do edgedetect é de bordas brancas na tela preta,
Se as opções edgedetect não fornecerem ajustes suficientes, execute um filtro convolução antecipadamente.
ffmpeg -i in.mp4 -vf "convolution=0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:enable='gt(mod(t,60),57)',edgedetect=enable='gt(mod(t,60),57)',negate" -c:a copy out.mp4