Estou pensando que isso é causado pelo fato de que historicamente A: foi reservado para uma unidade de disquete (junto com B :), e como os documentos nessas unidades são de natureza muito transitória, indexá-los não faz sentido.
Não me surpreenderia se houvesse algum código Windows95 / 98 obsoleto (o que, se bem me lembro, foi quando a indexação de pesquisa foi implementada pela primeira vez, e os disquetes ainda eram comuns) com uma exceção codificada para A: e B:
Tente remapear a unidade para D: ou outra coisa e ver se isso faz diferença.