Usando o "Apagar disco inteiro", apagará todas as partições.
Como você é novo, recomendo começar com a inicialização dupla com o Windows primeiro. Acostume-se ao Ubuntu e então você pode decidir mais tarde remover completamente o Windows. Isso é especialmente recomendado se você não tiver uma mídia de recuperação ou outro meio de reinstalar o Windows, se desejar.
Em qualquer caso, eu recomendaria fazer um backup de seus dados importantes em um disco externo antes de tentar instalar o Ubuntu. Se algo der errado, seus dados estarão seguros.