Nos comentários da resposta do @cgross, parece que não sou o único, que não ajudou a atualizar o SpamAssassin para o 3.4.0
Então, vou criar minha própria resposta a partir do que fiz.
Faça o download dos patches com
wget "http://svn.apache.org/viewvc/spamassassin/trunk/lib/Mail/SpamAssassin/Conf/Parser.pm?r1=1642207&r2=1642206&pathrev=1642207&view=patch" -O parser.pm.patch
wget "http://svn.apache.org/viewvc/spamassassin/trunk/lib/Mail/SpamAssassin/Conf.pm?r1=1642207&r2=1642206&pathrev=1642207&view=patch" -O conf.pm.patch
Mude para a raiz e corrija os arquivos
su
patch /usr/share/perl5/Mail/SpamAssassin/Conf/Parser.pm < parser.pm.patch
patch /usr/share/perl5/Mail/SpamAssassin/Conf.pm < conf.pm.patch