O mantenedor do pacote escolhe um nome que acha que faz sentido.
No caso do produto "Servidor HTTP" da Apache Software Foundation, faz sentido nomear o RPM após o programa específico, não depois da organização, pois produz muitos produtos .
$ ps -ef | grep httpd
apache 21416 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21417 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21418 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21419 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21420 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21421 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21422 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
apache 21423 31916 0 Sep09 ? 00:00:00 /usr/sbin/httpd -k start
root 31916 1 0 Jul26 ? 00:00:01 /usr/sbin/httpd -k start
Veja o link
The ASF [Apache Software Foundation] is made up of over 100 top level projects that cover a wide range of technologies.
Algumas distribuições terão convenções de nomenclatura para pacotes, por exemplo link