Se você planeja usar apenas uma placa gráfica dedicada, então não - o núcleo gráfico interno da CPU seria inútil.
Talvez você possa usar algo como o Nvidia Optimus para economizar energia usando apenas a GPU dedicada para tarefas gráficas intensivas, como jogos ou computação de GPU, e alternar automaticamente para a GPU interna para todo o resto. No entanto, não sei se essa tecnologia está disponível para computadores desktop.
Em qualquer caso, o núcleo interno (mesmo em combinação com a GPU dedicada, se possível) só pode ser usado se a sua placa-mãe fornecer as conexões necessárias da CPU para a ponte sul e algum tipo de porta gráfica (VGA, DVI , DisplayPort ou HDMI).