Nota: minha resposta assume que você conectou todos esses cabos Cat6 em um roteador ou switch ethernet. Minha resposta também assume que todos os cabos foram fixados e terminados corretamente.
If I were to have a fully compliant cat6 or cat6a network running through my walls... that is to say, wires and jacks... What would be the concequence of plugging a cat5e wire into one of the jacks?
Falando como engenheiro de rede profissional, a única consequência significativa é possivelmente a menor velocidade negociada nesse link em particular.
I'm assuming that it would still run at cat5e standards, but obviously not cat6/6a standards because the whole connection is not cat6.
suposição correta
will doing so hamper the whole network?
Não. Além disso, a razão convincente para o uso de fiação classificada acima de Cat5e é de 1GigE ou 10GE; no entanto, o Cat5e também é capaz de 1GE .