Qual é a diferença entre eles? ... eu quero dizer como se eu criasse um documento no MS-Office, que problemas poderiam ocorrer se eu quiser editá-lo depois com ooo.org?
Geralmente, há apenas pequenos erros de formatação. Existem alguns casos extremos em que o uso de um Recurso Brand New no Office não funciona com OOO / LO e vice-versa, mas essas são exceções.
A maior diferença é a interface. Alguém que está acostumado com o Office 2007 demorará um pouco para encontrar sua zona de conforto com qualquer coisa além dos recursos básicos em OOO / LO.
Ele deve ser adicionado aqui - o Word 2007+ - suporta .odt (é um formato de arquivo OO / LO) - enquanto o Word 2003 não.
Na minha experiência - você pode interagir com ambos - Word e OO / LO - se e somente se - você não usa nenhum recurso de formatação sofisticado.