Eu também experimentei algo semelhante no Xubuntu e percebi que existem lugares diferentes para alterar o volume e para silenciar / ativar o áudio. Tenho certeza que é mais ou menos o mesmo no Ubuntu. Então confira:
- O controle de volume na barra de tarefas. Também clique com o botão direito e abra as configurações detalhadas. A placa de áudio correta está selecionada como saída?
- Pesquise configurações alternativas do mixer no menu. Provavelmente em Multimídia
- Talvez tente alsa-mixer de um console
- Verifique se há algum swtiches de hardware. Muito improvável se for um PC, em notebooks, às vezes, há interruptores de hardware que sobrescrevem qualquer configuração do sistema operacional