Acho que o que você precisa avaliar é por que você precisa criptografar a máquina.
O motivo também pode nos ajudar a determinar o que é melhor para você. Criptografia atualmente, especialmente quando você está falando sobre criptografia de disco inteiro, é basicamente útil apenas para evitar um ataque - ou seja, alguém pegando sua máquina enquanto ela estava desligada, e você quer evitar que ela coloque os dados dentro dela.
Para a maioria dos outros fins, é melhor investir em
(1) controle de acesso à rede, que inclui, sem limitação, segurança sem fio e uso de protocolo criptografado (por exemplo, ssh em oposição a telnet, https em oposição a http), uso de VPN quando em redes públicas (2) segurança baseada em arquivo ou em container, isto é, algo como truecrypt - este é o caso quando você tem algo a esconder (ilegal, secreto ou não), e porque não é criptografia completa de disco que você ganhou não tem que montá-lo o tempo todo. (3) segurança física - é velho dizer que o acesso físico é igual a raiz. embora isso possa não ser verdade hoje em dia, ainda há algum peso.
Para sua pergunta - - se diminuirá o desempenho se as unidades forem logicamente separadas - normalmente não. O volume do Bitlocker só é criptografado / descriptografado quando há acesso, e a criptografia hoje em dia é uma questão muito simples, e não sobrecarregará muito a sua CPU, a menos que seus segredos sejam grandes, grandes fluxos de vídeo ou imagens para esse assunto. - leitura / escrita não sobrecarregará o disco rígido mais que 1.1x (com overheads) quando não estiver criptografado. A carga da CPU é insignificante hoje em dia se a R / W não for significativa na unidade de dados durante o jogo.