Primeiro, você precisa descobrir qual pacote fornece esse arquivo. Você pode usar a pesquisa de conteúdo do pacote Debian para isso: link
Ele então dirá libc6-dev . Você reinstalaria o pacote:
apt-get install --reinstall libc6-dev
Se isso não ajudar, consulte este artigo sobre como remover um pacote, ignorando as dependências :
dpkg --purge --force-depends libc6-dev
apt-get install libc6-dev
Por que isso acontece? Só podemos adivinhar. Talvez o cartão SD tenha corrido mal? Tente verificar o sistema de arquivos.