Não conheço uma maneira de obter exatamente o que você descreveu, mas há algumas configurações do Windows ou programas de terceiros que podem ser semelhantes, o que pode funcionar dependendo do que você deseja para realizar com esse comportamento.
Dê um foco à janela sem clicar:
Existe uma configuração no Windows 7 que irá ativar qualquer janela (dar foco) apenas passando o mouse sobre ela por um tempo (costumava estar no pacote TweakUI para versões anteriores do Windows). Para acessar isso no Windows 7, vá para o Centro de Facilidade de Acesso no Painel de Controle. Clique no link "Tornar o mouse mais fácil de usar" e marque a caixa que diz "Ativar uma janela passando o mouse sobre ela".
Role na janela que estiver sob o cursor (sem obter foco):
Para isso, você precisará de uma ferramenta de terceiros. Existem vários por aí que fazem isso, mas o que eu uso é um livre chamado X-Mouse Button Control . Isso é ótimo se você tiver várias janelas abertas (em um monitor ou em vários monitores) e quiser rolar cada uma delas independentemente, sem ter que clicar nelas todas as vezes antes de rolar a tela. O Controle de Botão do X-Mouse também pode ser configurado para ativar a janela na qual você rola. No entanto, eu uso-o sem ativar, porque muitas vezes eu quero rolar através de um tutorial ou StackOverflow sem perder o lugar onde eu estava codificando na minha outra tela.