Supondo que você esteja acessando o Dropbox através de seu site (e não através do aplicativo): pastas maiores que arquivos de 1GB ou 10.000 não podem ser baixadas dessa forma.
It's not possible to use the website to download an entire folder that's over 1 GB or that has over 10,000 files. If the folder is in your account, use the Dropbox desktop application to download the entire folder to your computer automatically.
(De link .)
Você terá que dividir seu download em várias tentativas ou alternar para o uso do aplicativo do Dropbox.