Existem muitos plugins para destacar páginas da web.
Você pode tentar Yawas que faz exatamente o que parece procurar (destacando nas páginas dentro do Chrome) . Enquanto instalado, você tem que editar suas configurações para armazenar localmente os destaques, caso contrário, irá armazená-los no Google Bookmarks.
Você pode pesquisar 'destaque' na Chrome Web Store para algumas outras opções. Acho que há um monte de outras soluções lá.