Estou finalmente atualizando. Acabei de chegar à tela "Remover Pacotes Obsoletos" e, enquanto vislumbro, notei alguns pacotes que eu instalei e não querem remover. Ele lista cerca de 150, então eu prefiro não manter 145 pacotes que eu não preciso.
Existe alguma maneira que eu possa dizer "Manter esses dois pacotes, mas se livrar do resto"?
Apenas deixe todos eles instalados por enquanto e remova aqueles que você não precisa mais com o Synaptic (você será capaz de ver seu "Status" no Synaptic).
Exemplo de screenshot (obrigado @htorque!) do Synaptic mostrando a categoria de pacotes obsoletos:
