Uma solução de GUI seria usar um cliente compatível com o Maildir, como o Evolution , criar duas contas nele (uma delas lê o Maildir, outro que faz o login no servidor IMAP), e apenas copia a pasta de correio usando a GUI do Evolution.
É claro que, se você quiser, o pine e o mutt também entendem o formato Maildir e o protocolo IMAP.