Por suposto, você ativou as guias em um aplicativo que não as suporta - o resultado aparece como uma barra de título dupla.
O Sierra vem com um recurso que permite que aplicativos compatíveis criem várias guias em uma janela, muito parecido com um navegador da web. Em uma aplicação incompatível, acessando isto - usando Cmd ⌘ Deslocamento ⇧ T gerará uma segunda barra de título abaixo da regular, sem forma aparente para se livrar disso.
Tente pressionar Cmd ⌘ Shift ⇧ T novamente e, em seguida, reinicie o aplicativo.