Você pode excluir e reutilizar a partição Ububtu de dentro do Gerenciador de Disco do Vista.
Apenas tenha cuidado, já que você não pode reiniciar sem primeiro consertar o Bootloader.
Existem duas maneiras de restaurar o bootloader do Vista:
Recuperando o Vista ou o Windows 7 Bootloader do DVD
Recuperando o Gerenciador de Inicialização Vista com o EasyBCD
E cuide dos seus backups antes de realizar qualquer trabalho de partição.
Nota: A ordem das coisas depende de qual partição é a primeira.
Se o Ubuntu estiver após o Windows, primeiro faça o EasyBCD e verifique se o boot funciona, então exclua / reutilize o Ubuntu.
Se o Ubuntu for antes do Windows, você não poderá excluí-lo, pois o Windows se refere à sua própria partição pelo seu número. A remoção completa da partição do Ubuntu exigirá a reinstalação do Windows. Se isso for inaceitável, sugiro fazer o EasyBCD primeiro e verificar se a inicialização funciona, e só então reformatar a partição do Ubuntu como outro disco do Windows ou redimensionar o Ubuntu para um tamanho pequeno e deixá-lo sozinho, talvez movendo a partição do Windows. Isso exigirá uma boa ferramenta de partição disponível como CD de inicialização.