Meu modelo Macbook Pro de 13 polegadas com retina no início de 2015 está configurado tanto para o filevault 2 quanto para o Windows 10 enterprise com o bitlocker ativado.
Eu fiz muita leitura e encontrei alguns guias, um deles foi o que você listou. Eu acho que da memória ele perdeu um passo necessário no El Cap sobre nova segurança para permitir que a partição fosse criada.
Eu tive que inicializar na recuperação osx e executar o csrutil disable para permitir que o software de partição fosse executado corretamente