Não há software que faça isso, então a única maneira de fazer isso é escrevendo um script que basicamente dê uma variável a +1 a cada segundo (ou minuto) e tenha uma maneira de ler o valor da variável. Se o seu PC estiver em hibernação / suspensão / etc, o script não está em execução, portanto, o contador não é aumentado.
É provável que isso cause impacto no sistema se tal script estiver sendo executado constantemente em segundo plano, então a questão é: o quanto você quer isso?
(motivo do impacto no script) quanto mais tempo o script é executado, maior o número se torna e um valor que é realmente alto significa que ele precisa de mais memória para armazenar. (falando sobre valores que não podem ser inteiros (65535), mas suponho que, se você for tão alto, seu sistema deve estar funcionando por dias / semanas. Naturalmente, você poderia escrever seu script para contar dias e redefinir o valor que eliminaria isso, mas se, então, o seu script estiver passando por mais código em seu ciclo, o que por si só também causará impacto, mesmo que pouco.
