Além de tornar o computador exclusivo, ele também remove os drivers antigos e prepara o sistema para um novo conjunto de hardware (se você marcou "Generalizar").
A exclusividade é crucial apenas em redes de domínio para que a autenticação funcione corretamente, mas a parte dos drivers também é importante para os computadores autônomos.
Resumindo, a maior parte do tempo funcionará, mas manterá os drivers antigos e inúteis.
Eu acho que é melhor fazê-lo corretamente, então você não terá nenhum problema imprevisto.
De qualquer forma, por que não usar o sysprep?
Você pode clonar como você fez, só você terá que reativar.