Tente deletá-lo pelo id do arquivo que normalmente é o número do inode em sistemas de arquivos baseados em ext, mas para NTFS espero que exponha o equivalente do id do arquivo NFTS que é o que você pode tentar usar para excluí-lo.
Não há garantias de que isso funcionará, mas vale a pena tentar. Algo como:
matt@mattdev::/tmp/ls -il
total 0
20090 -rw------- 1 matt matt 0 Apr 26 18:27 tmpQJyK5Q
16284 -rw-rw-r-- 1 matt matt 0 Apr 26 18:26 unity_support_test.0
seguido por:
find . -inum 20090 -exec rm -i {} \;
Claro, o acima não está usando o NTFS, mas ext4. Estou curioso para saber se funciona ou não.