Não realmente. Para a maioria dos sistemas de arquivos principais, o sistema de arquivos só desempenha um grande efeito na maneira como os dados são armazenados no disco. Quando está na memória, faz parte do Virtual File System do kernel. Alguns recursos do sistema de arquivos, como criptografia e deduplicação de dados, requerem memória adicional, mas são facilmente desativados.
Diferentes sistemas de arquivos podem ter diferentes requisitos de CPU, em termos de dados de leitura / gravação. Usar um sistema de arquivos com diário como o Ext3 / 4 em comparação com um sistema de arquivos não journaled como o Ext2 exigirá um poder de processamento marginalmente maior para salvar um arquivo.