Primeiro, eu absolutamente ficaria longe das opções de gráficos 3D. Há muitas razões para listar aqui, mas esta postagem no blog por Jon Peltier vale a pena um bom lugar para começar.
Você tem três opções relativamente boas para mapear três variáveis, mas precisa brincar com seus dados para determinar o que é melhor para a história que está tentando contar.
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Os gráficos de bolhas usam o layout básico de um gráfico XY ou Scatter, mas permitem codificar uma terceira variável no tamanho do ponto de dados. Isso cria um problema semelhante ao dos gráficos de pizza na dificuldade de interpretar e comparar as áreas relativas dos círculos.
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Os gráficos de dispersão podem ser usados de maneira semelhante a um gráfico de bolha, mas com várias séries ou pontos de dados codificados por cor ou forma. Isso provavelmente é melhor para dados categóricos.
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Os gráficos de painel podem ser sua melhor opção. Crie uma série de Gráficos de Dispersão que sejam idênticos (em escala e formatação), mas que variem apenas com base em uma de suas variáveis (por exemplo, pH). Apresente-os em uma matriz e eles permitirão uma comparação fácil.
EDITAR: Depois de considerar mais a descrição dos seus dados, não acho que um gráfico de bolhas seja uma boa opção. Você parece ter 5 séries de dados (para cada nível de pH), cada uma com dois valores (30 e 60 segundos). As opções 2 ou 3 acima ainda são boas ou você pode considerar um Gráfico de Bump (pode ser criado como um Gráfico de Linhas no Excel). Se você puder fornecer uma amostra de dados, seria fácil demonstrar algumas dessas opções.
EDIT2: Depois de um pouco mais de consideração, já que seus dados são apenas 10 pontos, eu usaria um Gráfico de Dispersão regular. Como você não tem medições de intervalo entre 30 e 60 segundos, não acho que uma linha seria apropriada, pois isso implicaria esses valores. Em vez disso, basta traçar e rotular seus 10 pontos. Aqui está uma amostra de como poderia ser:
EDIT3:DadosdográficorevisadoscombasenasugestãodeJonPeltier.
E, para arredondar as coisas, um gráfico de bump.