Em termos lógicos, o serviço FTP faz parte do IIS, que é uma coleção de serviços, daí o nome 'Internet Information Services'.
No Windows Server, a função é chamada de 'Servidor Web (IIS)', o que é um pouco enganador porque você pode executar o serviço ftp sem instalar nenhum serviço relacionado ao http.
O serviço FTP é executado como seu próprio processo de Serviço do Windows 'Serviço FTP da Microsoft' (svchost.exe -k ftpsvc)