Aqui está uma boa explicação de como definir essas configurações: link
O que você provavelmente quer é arandr (sudo apt-get install arandr) - > acessá-lo através de: preferences - > Arandr
A GUI é bastante intuitiva.
Se você tiver um driver NVIDIA, a solução será um pouco diferente. É explicado no (excelente) screen-cast.