Tenho certeza de que é possível que um controlador corrompa o sistema de arquivos do disco rígido, mas eu esperaria que, se a unidade fosse colocada em outro sistema, você seria capaz de formatar a unidade e usá-la sem danos permanentes. Eu não direi que é impossível que um controlador possa danificar permanentemente uma unidade de alguma forma, isso parece improvável para mim.
No que diz respeito a "algo a mais" que destrói o disco rígido, acho que um culpado mais provável por causar inacessibilidade permanente é a fonte de alimentação do computador ou até mesmo a eletricidade que sai da parede, se você mora um lugar que sofre tempestades de raios, quedas de energia ou cortes de energia de qualquer tipo, aterramento ruim ou qualquer outra coisa que possa causar energia "suja".