Tente isso ...
Durante a instalação do Windows 7, quando chegar ao ponto de partição do disco, pressione Shift+F10
no prompt de comando e execute esses comandos.
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diskpart
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list disk
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select disk X
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clean
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create partition primary size=300
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select partition 1
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format fs=ntfs label="System"
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assign letter=S
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active
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create partition primary
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select partition 2
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format fs=ntfs label="Windows"
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assign letter=C
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exit
Substitua X em select disk X
pelo número do disco rígido que você vai usar encontrado durante list disk
... esses comandos limparão a unidade e criarão duas partições, o Sistema em 300MB e o C: \ preenchendo o resto do espaço.
Em seguida, siga com a instalação como normal selecionando a partição C: \ criada.
Editar: Esqueci de informar que você precisa clicar em Atualizar depois de sair do prompt do DOS para ver as partições recém-criadas.