Não há nenhuma maneira nativa de desativar as teclas de atalho no Windows 7. (A propósito: Os atalhos que você mencionou não são teclas de atalho padrão no Windows 7.)
No entanto, você pode usar o AutoHotkey para desabilitar praticamente qualquer atalho de teclado. Existem outros utilitários para isso, mas o AutoHotkey é a minha arma preferida.
Você pode desativar as teclas de atalho mencionadas aqui com o seguinte código:
^!F1::return ; disables Ctrl-Alt-F1
^!F2::return ; disables Ctrl-Alt-F2
^!F3::return ; disables Ctrl-Alt-F3
^!F4::return ; disables Ctrl-Alt-F4
Basta colar o código em um script AutoHotkey que você inicia na inicialização e as chaves serão permanentemente desativadas.
Se você quiser reatribuir as teclas de atalho para outra coisa, faça o seguinte:
^!F1::Send ^{Enter] ; sends Control-Enter when pressing Ctrl-Alt-F1
^!F2::some boilerplate text ; types phrases
Por acaso, forneci uma resposta para uma pergunta semelhante: Como você desabilita as teclas de atalho no Internet Explorer 9?