Seu script parece não conseguir encontrar o módulo pygraphviz . Para corrigir isso, você deve se certificar de que pygraphviz esteja no sys.path do seu Python.
Caso você descubra que o módulo não está instalado, você tem duas maneiras alternativas de instalá-lo:
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sudo apt-get install python-pygraphviz(como sugerido pela mensagem de erro), -
sudo apt-get install graphviz libgraphviz-devesudo pip install pygraphviz --install-option='--include-path=/usr/include/graphviz' --install-option='--library-path=/usr/lib/graphviz'
Este é o método que eu recomendo strongmente, que usapip, o instalador do pacote Python. Especificar as opções é necessário porque senão o instalador do pygraphviz parece incapaz de encontrar o caminhos .