Eu uso o Final Cut Pro Studio da Apple e Soundtrack Pro . Aqui está um ótimo tutorial sobre como fazer isso: Remoção de Ruído Cirúrgico .
Como você é um usuário do Windows, não posso ajudá-lo com a edição de áudio. A maioria dos programas de áudio, incluindo o Audacity , inclui portões de ruído, para que você possa usá-lo para algo. Infelizmente, a remoção cirúrgica é relativamente única.
Se você realmente não conseguir lidar com isso, compre Pro Tools . Eu odeio isso, mas tem o que você está procurando.