Não sei ao certo o que está causando o problema, mas gostaria de tentar instalar o mais recente flash player o site adobe. Eu acho que eles corrigiram alguns bugs desde a versão nos repositórios.
Estou usando o ubuntu jaunty (realmente o kubuntu, mas não importa) com o firefox 3.0.12 e o plugin flash 10 da adobe, e muitas vezes tenho o problema que o firefox congela enquanto jogo hulu. O vídeo congela, mas o som continua tocando e não consigo navegar no firefox (por exemplo, não consigo fechar a janela, por isso preciso matá-lo). Isso só acontece quando estou jogando em tela cheia ou em uma janela independente (não no pequeno vídeo incorporado na página da Web, mas não testei isso extensivamente).
Não sei ao certo o que está causando o problema, mas gostaria de tentar instalar o mais recente flash player o site adobe. Eu acho que eles corrigiram alguns bugs desde a versão nos repositórios.
Estou executando o Windows, mas para o problema de tela cheia instável: clique com o botão direito do mouse no vídeo em Flash e desmarque "ativar a aceleração de hardware". O que funcionou imediatamente para mim.
Tente desabilitar o adblock, que funcionou para mim.
Eu tenho o mesmo problema. O desempenho do flash no Ubuntu tem sido terrível por um bom tempo, apesar de certas placas de vídeo parecerem piores do que outras. Estou executando um nvidia 6200. Vídeo em flash em tela cheia é sempre instável, e o hulu para precisamente como você descreve.
É triste dizer que depois de alguns meses tentando todas as dicas que consegui encontrar, nada melhorou.
No entanto, ele parece limitado a vídeos em flash, já que os sites em flash geralmente funcionam bem, e eu posso reproduzir conteúdo em HD de unidades locais e em rede.