É provavelmente uma interação entre construção e controlador de disco "físico", tamanho de bloco "lógico" e solicitações de gravação de software (se eu tiver esse direito) de modo que (por exemplo) transferir um arquivo em pedaços maiores (1MB) pode ser muito mais rápido do que a mesma quantidade escrita em partes menores (4KB).
Os tamanhos exatos variam com base na fabricação e no sistema de arquivos. Eu acho que o padrão do NTFS é 4KB por exemplo. E algumas das escolhas do sistema operacional para sistemas de arquivos são um compromisso entre o desempenho de arquivos grandes e arquivos pequenos.
Os HDDs têm uma curva mais plana, mas podem realmente superar o SSD em determinadas circunstâncias. Então olhe para isso. leitura relacionada:
Tudo o que foi dito, eu iria adiar para alguém com mais experiência em hardware.