Entre mim e outra pessoa que estava enfrentando o mesmo problema, determinamos que a falha está no PowerDVD 16. Estávamos usando a versão de avaliação de 30 dias e, aparentemente, a versão de avaliação não oferece suporte a BluRays 3D, dando a impressão (na interface do usuário) que o 3D está ativo!
A página de download do PowerDVD diz:
Limitations
Does not support the playback of HEVC/H.265/Blu-ray 3D content.
A outra pessoa comprou a versão completa do PowerDVD e agora o 3D funciona.