Eu tive que baixar o VDDK do link , em seguida, navegue até a pasta que contém o meu vmdk e execute ( em um terminal):
sudo <path-to-vdiskmanager>/vmware-vdiskmanager -R <name-of-vmdk>.vmdk
Se o reparo for bem-sucedido, você deverá ver:
The virtual disk, '<name-of-vmdk>.vmdk', was corrupted and has been successfully repaired.
Também lançamos a caixa de dentro da interface do VirtualBox e tivemos que reconectá-la com:
VBoxManage storageattach <name-of-box> --medium "<path-to-vmdk>.vmdk" --storagectl "SATA" --device 0 --port 0 --type hdd