Há um pergunta semelhante , mas as respostas não conseguem resolver o problema de" achatar "anotações, ou seja, transformá-las de anotações em conteúdo real.
Uma maneira é imprimi-los em PDF, mas isso pode resultar em perda de qualidade, especialmente de imagens digitalizadas no PDF. Existe uma maneira de conseguir isso, de preferência usando uma ferramenta de linha de comando do Linux como o pdftk, que pode preservar tudo no PDF como está e apenas adiciona as anotações como conteúdo?
A resposta aceita sobre a mesma pergunta, Como posso achatar totalmente um PDF no Mac OS na linha de comando? parece funcionar para" assar "ou" achatar "anotações em PDF como conteúdo em PDF:
gs -sDEVICE=pdfwrite -dPDFSETTINGS=/default -dNOPAUSE -dQUIET -dBATCH -sOutputFile=out.pdf input_with_annots.pdf
... e parece mesmo preservar o texto da anotação (por isso é copypastable, juntamente com o conteúdo do texto original).
Testei isso no Ubuntu 14.04, Ghostscript gs --version 9.10.
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