Em shell scripts você pode usar wmctrl (não instalado por padrão no Ubuntu, mas você pode instalá-lo usando o gerenciador de pacotes) para mover e redimensionar janelas.
O script a seguir redimensiona a janela atual para 90% da largura e altura da tela:
#!/bin/sh
set -- $(xwininfo -root| awk -F '[ :]+' '/ (Width|Height):/ { print $3 }')
width=$1
height=$2
wmctrl -r :ACTIVE: -e 0,-1,-1,$((width*90/100)),$((height*90/100))
Isso deve funcionar no Xubuntu também.