Eu não recomendo necessariamente esse curso de ação, mas você poderia colocar algo como:
alias evince='evince 2>/dev/null'
que removerá todo o erro padrão do evince. Eu acho que o menor incômodo de vê-los é melhor do que a única vez que o Evince realmente falhará e não lhe dirá por que, mas é uma opção.
Você também pode fazer algo mais extravagante se usar o bash, como:
alias evince='evince 2> >( grep -v "evince.*WARNING" >&2 )'
para filtrar linhas específicas do erro padrão. Isso pode ser mais seguro, mas não estou necessariamente endossando isso.