Os arquivos MSI podem ser configurados para instalar arquivos em qualquer lugar, de modo que não haja suposições definidas que você possa fazer.
Você pode usar Orca para examinar o arquivo msi , especificamente, o Arquivo e Tabelas para ver onde os arquivos provavelmente serão instalados.
Você também pode tentar um script vbs que automatize esse processo para você, embora eu não tenha tentado eu mesmo.