Você pode querer usar uma solução diferente de backup / criação de imagens. Programas semelhantes ao Acronis e ao Ghost copiarão todas as informações do HAL e do driver e darão a você problemas para inicializar em uma máquina diferente.
Se você não quiser mudar muitas das suas imagens para um ambiente virtual, recomendo pesquisar a ferramenta Sysprep da Microsoft. Isso basicamente retira muitas informações que normalmente quebrariam uma imagem ao carregar em outra máquina e prepararia a imagem para implantação.
Mais informações sobre o Sysprep podem ser encontradas aqui: link
Você pode emparelhar essa ferramenta com o 'ImageX', também disponível na Microsoft, e ela se torna uma ferramenta de imagem bastante poderosa. O ImageX é gratuito, mas é tudo linha de comando, a menos que você use uma GUI criada para ele.
Mais informações sobre o ImageX podem ser encontradas aqui: link