Ext2fsd e ext2explore parecem ser as escolhas mais populares na web para o trabalho que você deseja. No entanto, tenha em mente que eles nem sempre deixam o sistema de arquivos linux em um estado consistente.
De qualquer forma, essas opções não funcionam para você e não conheço um aplicativo confiável que possa fazer o que você deseja. A melhor coisa a fazer é usar um live cd linux (ubuntu, filhote de cachorro linux, maldito pequeno linux, etc) para inicializar seu pc a partir dele e então fazer qualquer coisa na partição ext4 como um chefe.