Você pode fazer algumas das coisas que o wmctrl pode fazer no OS X via AppleScript. Aqui está um exemplo .
Faça alguma pesquisa no AppleScript. Pode ser muito útil.
Além disso, há um aplicativo chamado permaneça . Definitivamente não tem quase tantas opções quanto o wmctrl, mas quem sabe, pode ser tudo que você precisa.
Editar:
Por pedido do solicitante, aqui é grátis! ShiftIt . Eu ainda recomendo AppleScript, é o mais difícil dos três para dominar, mas também é o mais poderoso.