Não, não é "seguro".
O que você fez é permitido para qualquer processo executado sob seu nome de usuário para ter acesso inquestionável a todos os arquivos em que o comando funcionou. Antes, o UAC teria, pelo menos, solicitado (supondo que você tinha isso ativado) a ação do usuário antes de continuar, já que eles eram de propriedade do sistema (mesmo que você tivesse acesso como administrador). Agora, eles são como se fossem seus arquivos, então o processo pode fazer quase o que quiser com eles.
A solução mais fácil é fazer backup dos dados do usuário e reinstalá-los. Existem supostas ferramentas que consertam permanentes, mas eu acho que isso é uma tentativa.
Não há absolutamente nenhum motivo para reivindicar a propriedade de um conjunto de arquivos do sistema (exceto para casos extremamente extremos). Se um guia está dizendo para você se apropriar de um monte de pastas / arquivos do sistema - não é um guia muito bom. Deveria pelo menos dizer "nunca use isso em produção / consumo".