Aqui está uma solução possível, que funciona, embora eu não saiba se é boa.
#!/bin/bash
EXPECTED_ARGS=3
E_BADARGS=65
if [ $# -ne $EXPECTED_ARGS ]
then
echo Not the right number of arguments
exit $E_BADARGS
fi
for i in $( ls $1* ); do
TMP=$(echo $2$(echo $i | cut -d'_' -f2))
TMP2=$(echo $3$(echo $i | cut -d'_' -f2))
convert $i $TMP +append $TMP2
done
A execução deve ser algo como:
script foo_A_ foo_B_ out_